Diagenode

次世代シーケンシング

DNA/RNA断片

近年の次世代シーケンシング(NGS)の進歩はゲノミクスや生物学に革命をもたらしました。 この成長により、最適なサンプル調製、ゲノムライブラリー構築には欠かせない高度技術の要求、必要性がさらに高まっています。 最適なライブラリー調製に最も重要な要因の一つは、シーケンシングされるDNAの品質です。 まずは、DNAを効果的かつ一貫してシーケンシングプラットフォームに応じた適切な断片サイズに切断し、具体的で信頼できるNGS結果を実現する必要があります。 Picoruptor and Megaruptor®なら、次世代シーケンシングワークフローに不可欠な高サンプル収率、フラグメントサイズ、そして一貫性を実現できます。当社ガイドラインに沿って、DNAサイズに適したパラメーターを見つけてください: Picoruptor®でDNAシェアリング.

PicoruptorDNAサイズ分布がプログラム可能で高度な再現性を持ちます。0.65(パネルA)または0.1 ml(パネルB)マイクロチューブを使用した実験例。 パネルA100μlの容量を用いて13サイクル後に200bp13秒オン/オフ)。 平均サイズ:204; CV%:1.89%) パネルB10μlの容量を用いて、20サイクル後に200bp30秒のON / OFF)。 (平均サイズ215bp; CV%:6.6%)。 パネルAB:ピークエレクトロフェログラム図。 パネルCD:バーチャルゲル・ビュー。



短いフラグメントサイズのハイドロポーラスを使ったMegaruptor®による再現性があり短いDNA分布を行いました。これは2つの異なるDNA源と2種類の分析方法で、検証されています。 A:ラムダファージゲノムDNA(20ng /μl;150μl/サンプル)を多様な速度設定でせん断し、1%アガロースゲルで分析。 B:2および5kbの異なるソフトウェア設定でせん断されたヒトゲノムDNA(20ng /μl;150μl/試料)のBioanalyzerプロファイル。 3つの独立した実験を各設定に対して実行。 (分離およびフラグメントサイジングのためにAgilent DNA 12000キットを使用)。
Megaruptor®による、長い断片サイズのハイドロポアを用いた15kb75kbフラグメントサイズのせん断を実証しました。 画像は、長い断片のハイドロポアでせん断されたヒトゲノムDNADNAサイズ分布を示します。 1%アガロースゲル中でパルスフィールドゲル電気泳動(PFGE)によりDNAを分析し、平均サイズのスミアをImage Lab 4.1ソフトウェアを用いて推定します。
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は未交換DNAを示します。

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